研究稱新的基因研究顯示武漢動物市場是新冠病毒大流行的起源


科學家表示,對 COVID-19 大流行最初幾週從武漢活體動物市場收集的遺傳物質進行的新分析證實了當冠狀病毒從受感染的動物傳播到人類時,疫情就起源於該市場的情況。

發現根據《細胞》雜誌報道,沒有發現任何將 SARS-CoV-2 病毒帶入人口超過 1,100 萬的中國城市的特定受感染動物。他們也沒有明確證明華南海鮮批發市場是一場導致疫情的歸零地。 超過700萬人死亡

但研究作者表示,基因證據表明該市場滿足了引發疫情爆發的必要條件,這使得解釋冠狀病毒如何從實驗室、農場甚至從該市四個活體動物市場中的另一個市場出現變得越來越困難。

參與這項研究的亞利桑那大學進化生物學家邁克爾·沃羅貝(Michael Worobey) 表示:「這就好像一種大猩猩病毒在聖地亞哥出現,首先感染了在聖地亞哥動物園工作並居住在附近的人們,然後傳播得更廣泛。 “不難推斷,它很可能來自動物園裡的大猩猩。”

這場大流行病的根本原因自早期就一直受到激烈爭論。武漢是政府實驗室的所在地,科學家在那裡研究與SARS-CoV-2 類似的冠狀病毒,這一事實促使政治家、國家安全專家、深夜脫口秀主持人和包括沃羅比在內的許多科學家質疑該病毒是否是從武漢洩漏的。

儘管這一論點可能很有說服力,但一直缺乏支持洩漏假說的確切證據。同時,更多資訊的曝光讓相關領域的專業科學家相信,造成COVID-19的病毒起源於動物,就像引起SARS、MERS和流感的病毒一樣。

新的結果延續了這一趨勢,並說 多米尼克·德懷爾博士是世界衛生組織調查大流行起源的國際工作小組的成員。

澳洲雪梨大學和韋斯特米德醫院的醫學病毒學家德懷爾(Dwyer)表示:「你把所有這些起源假設都擺在桌面上,然後當你獲得證據時,其中一些假設會變得更加有力。 “這篇論文有更多證據支持華南市場的動物來源。”

週四發表的分析是基於中國疾病預防控制中心研究人員在 2020 年 1 月 1 日華南市場關閉後不久收集的數百個華南市場及其周邊地區樣本中收集的基因數據。雜誌上發表的報告,他們在測試的74 個環境樣本中檢測到了冠狀病毒。

沃羅比和他的同事深入研究了這些數據。他們使用兩種不同的基因定序技術來尋找 SARS-CoV-2 片段以及動物和人類的 DNA。

然後,他們在龐大的市場地圖上繪製了他們的發現,使團隊能夠重建一些最初的感染是如何膨脹為全球衛生緊急情況的。

2020年1月上旬收集的585個樣本中,含有冠狀病毒的樣本集中在市場的西南部。那正好是野生動物被關在籠子裡出售的地方。

「市場佔地幾英畝,這取決於市場的一個角落和幾個攤位,」德懷爾說。 “這符合動物起源。如果它是來自在市場裡徘徊的人們,你會發現它無處不在。

研究作者寫道,一個市場攤位「脫穎而出」。它在多個地方都有 SARS-CoV-2 的證據:至少一輛推車上、一個鐵容器上、地面上以及用於去除毛髮和羽毛的機器上。研究人員稱之為「野生動物攤位 A」。

2020 年 1 月底,從市場的排水系統中又採集了 60 個樣本。

2 月中旬,該排水管的 SARS-CoV-2 檢測結果仍呈現陽性。研究人員寫道,其下游的兩條排水溝也可能受到野生動物攤位 A 的徑流污染。

攤位中含有冠狀病毒的樣本還含有多種動物的 DNA,包括狗、兔子、白竹鼠、馬來豪豬和果子狸。最豐富的DNA來自貉,其中一些是在附近的垃圾車中檢測到的,該垃圾車的病毒檢測也呈現陽性。

已知的與野外存在的 SARS-CoV-2 最接近的冠狀病毒是在中國南部、寮國和越南的馬蹄蝠以及中國南部的穿山甲中傳播的冠狀病毒。但華南市場的所有樣本中均未發現蝙蝠或穿山甲的 DNA。

研究作者指出,貉、果子狸、白竹鼠和馬來豪豬以前曾傳播過蝙蝠冠狀病毒。他們想知道,他們能在武漢這樣做嗎?

2020年1月11日,保全人員站在已關閉的武漢華南海鮮批發市場前。

(諾埃爾·塞利斯 / 法新社,蓋蒂圖片社)

研究作者寫道,目前尚不清楚竹鼠或馬來亞豪豬是否會感染 SARS-CoV-2。沒有確切的證據顯示果子狸可以感染該病毒,但來自動物的細胞系在實驗室實驗中很容易受到影響。

另一方面,貉會感染和傳播 SARS-CoV-2。它們是A野生動物攤位中數量最多的動物。

研究人員深入研究了貉的 DNA,看看它們是否來自中國南方,在那裡它們可能與蝙蝠有過接觸。他們無法判斷,但可以排除與生活在中國北方毛皮養殖場的貉的連結。

Worobey 和他的同事也研究了在野生動物攤位中檢測到的非 SARS-CoV-2 動物病毒,看看它們是否提供了受感染動物來自何處的線索。

華南市場上感染果子狸的科佈病毒與在四川和廣西兩省銷售的動物中檢測到的病毒密切相關,這兩個省份距離馬蹄蝠和穿山甲的領地更近。感染竹鼠的β冠狀病毒在廣西的一個竹鼠養殖場有一個近親,廣西是已知市場商販採購竹鼠的兩個南方省份之一。

研究作者寫道:“這些發現表明,受感染的動物從中國南方轉移到了武漢,這一貿易管道也可能導致 SARS-CoV-2 的出現。”

巴黎法國國家科學研究中心的演化生物學家、該研究的資深作者佛羅倫斯·德巴爾(Florence Débarre) 表示,要弄清楚這一點需要進行更多調查,包括從中國動物身上收集樣本的實地工作。沃羅比表示,他計劃繼續進行這項調查。

德懷爾讚揚了為確定市場上的動物來自何處以及病毒如何進入市場所做的努力。

科學家說,第二條證據也支持這場流行病具有所謂的人畜共患起源的假設。

在2020年1月1日從華南市場採集的樣本中,研究人員鑑定出了四個幾乎完整的SARS-CoV-2基因組。其中一個來自所謂的A譜系,另外三個則來自密切相關的B譜系。

研究人員無法判斷這些病毒是由動物還是人類傳播的,但 A 譜系樣本來自 2019 年 12 月中旬一名工人就醫的攤位。該組織後來的一份報告將這名工人描述為疑似早期患者。

在確認市場上存在這兩種譜系後,研究小組可以比較它們的基因組,並向後推導出這兩種菌株何時出現分歧,以及它們最近的共同祖先是什麼樣子。他們提出了六名候選人,其中一些比其他人更可信。

研究負責人表示,四個最有可能的候選者之一有99% 的可能性是正確的,而這四個人都有一些重要的共同點:它們與整個大流行的最近共同祖先「等同或相同” Alexander Crits-Christoph,獨立計算微生物學家。

研究作者說,如果疫情從華南市場開始,他們會期望看到這樣的結果。在這種情況下,一隻或多隻感染病毒的動物在 11 月或 12 月初抵達市場。然後,病毒在室內近距離飼養的動物及其人類飼養員之間傳播。這些條件會給病毒提供多種機會在人群中紮根,並開始在人口稠密的城市的新宿主中傳播。

另一方面,將所有這些證據融入一個連貫的故事中變得越來越困難,即冠狀病毒通過進口冷凍食品進入中國(正如中國政府所聲稱的那樣)或從生物安全協議寬鬆的病毒學實驗室逃脫(正如一些人所聲稱的那樣)德懷爾說,美國情報界成員已提議。

「我們沒有添加任何東西來支持實驗室洩漏或冷凍食品理論,」他說。 “它只是繼續強化動物和市場假說。”

德巴爾說,考慮到這場大流行是在一個擁有病毒學實驗室的城市開始的,科學家在那裡研究冠狀病毒,因此有必要問這是否不僅僅是巧合,並懷疑有罪的證據是否被掩蓋。

「我們很多人都對這個想法持非常開放的態度,」她說。 “但隨後數據積累起來,它們都朝著同一個方向發展——它們都指向市場。”

「在科學領域,你很少有最終答案,」她補充道。 “你說,’鑑於我們擁有的所有數據,這看起來是最有可能的解釋。’”



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